Ujian Terbuka Program Doktor FK-KMK UGM Atas Nama dr. Fajri Marindra Siregar, M.Kom., M.Biomed.
Disertasi:
Potensi Circular RNA Sebagai Biomarka Diagnostik Noninvasif Untuk Hipertensi Arteri Pulmonal Pada Pasien Defek Septum Atrium Dewasa: Studi Eksploratif
Pembimbing:
- Prof. dr. Sofia Mubarika, M.Med.Sc., Ph.D.
- dr. Anggoro Budi Hartopo, Sp.PD., M.Sc., Sp.JP., Ph.D
Latar Belakang: Hipertensi arteri pulmonal (HAP) merupakan penyakit progresif dengan prognosis yang buruk dan tingkat mortalitas tinggi, serta membutuhkan pemeriksaan invasif untuk penegakkan diagnosisnya. Circular RNA (circRNA), sebagai molekul non koding dengan struktur melingkar yang stabil dan spesifik terhadap jaringan, memiliki potensi sebagai biomarker noninvasif melalui pendekatan liquid biopsy. Penelitian ini bertujuan untuk mengidentifikasi potensi circRNA sebagai biomarka diagnostik noninvasif untuk hipertensi arteri pulmonal pada pasien defek septum atrium dewasa (HAP-DSA) yang belum dikoreksi di RSUP Dr. Sardjito Yogyakarta.
Metode: Penelitian dilakukan menggunakan pendekatan profiling dengan mikroarray, validasi ekspresi menggunakan qRT-PCR, dan identifikasi fungsi biologis kandidat circRNA secara bioinformatik.
Hasil: Profil ekspresi circRNA menunjukkan perbedaan yang bermakna antara kelompok HAP-DSA dan kontrol (DSA-non HP), dengan 26 circRNA mengalami upregulasi dan 30 circRNA mengalami downregulasi. Salah satu circRNA, hsa_circ_0086475 (mengalami downregulasi), diidentifikasi sebagai kandidat biomarker utama berdasarkan analisis ekspresi dan relevansi biologisnya. Ekspresi hsa_circ_0086475 menunjukkan hubungan yang signifikan (p < 0,05) terhadap mPAP dan PVRI pada subjek perempuan, namun tidak ditemukan hubungan serupa pada subjek laki-laki. Analisis bioinformatik lebih lanjut menunjukkan keterlibatan hsa_circ_0086475 dalam meregulasi gen-gen kunci yang berperan dalam patogenesis HAP, seperti BMPR2, ATP13A3, CAV1, dan GDF2.
Kesimpulan: Berdasarkan ekspresi dan fungsi biologisnya hsa_circ_0086475 memiliki potensi sebagai biomarker diagnostik noninvasif terhadap HAP-DSA.
Kata kunci: Biomarker, circular RNA, congenital heart disease, pulmonary arterial hypertension
